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蛋白質(zhì)與RNA的互作: CLIP

染色質(zhì)免疫沉淀分析(CLIP) 實(shí)驗(yàn)意義

是染色質(zhì)免疫沉淀技術(shù)(Chromatin ImmunoPrecipitation assay)的簡(jiǎn)稱，屬于兔疫沉淀技術(shù)的一種，用于檢測(cè)蛋白質(zhì)與DNA的相互作用。

實(shí)驗(yàn)原理

其主要原理是基于RNA與其相應(yīng)的RNA結(jié)合蛋白會(huì)在紫外照射下會(huì)發(fā)生共價(jià)結(jié)合,以RNA結(jié)合蛋白的特異性抗體將RNA-蛋白復(fù)合物沉淀之后，回收其中的RNA片段，進(jìn)行qRT-PCR檢測(cè)或測(cè)序分析。

實(shí)驗(yàn)流程

1.根據(jù)研究目的決定研究方案，檢測(cè)抗體是否適用于Chip反應(yīng),設(shè)計(jì)檢測(cè)引物;

2.對(duì)生物樣品進(jìn)行甲醛交聯(lián);

3.超聲破碎基因組DNA

4.染色質(zhì)免疫共沉淀;

5.qPCR檢測(cè)或(克隆)測(cè)序;1

實(shí)驗(yàn)完成周期及交付標(biāo)準(zhǔn)

1.實(shí)驗(yàn)周期: 1-3個(gè)月 .

2.交付標(biāo)準(zhǔn): CLIP鑒定結(jié)果報(bào)告、分析報(bào)告、實(shí)驗(yàn)報(bào)告(試劑、 耗材、實(shí)驗(yàn)步驟)、原始數(shù)據(jù)等

需確認(rèn)的信息

1.目的基因與蛋白信息。

2.樣本類(lèi)型與種屬

3.是否需要生信分析

部分實(shí)驗(yàn)代做服務(wù)